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“90后”女博士攻坚新冠病毒检测
3上一篇 2020年06月12日 版面导航 放大 缩小 默认        

“90后”女博士攻坚新冠病毒检测

 

  6月6日,北京市疫情防控等级降至三级,各项生产生活开始逐渐恢复正常步调,学生回到久违的校园……在大家重新肆意拥抱生活的同时,经开区安诺优达基因科技(北京)有限公司(以下简称“安诺优达”)的实验室内外,姚佳英依然还在带着团队日复一日地研究着新冠病毒及已知和未知的病原微生物,以期快速完成可快速、精准检测病原类型测序系统“病原微生物检测与监控系统”的开发。

  姚佳英,是一名“90后”博士,自中学时期学习过基因、染色体相关知识之后,她便悄悄在心里种下了一颗生物研究的种子,为了满足自己对生物领域的好奇心,她本科时期选择了华中农业大学的生物工程专业,系统学习了生物相关的专业课程和生物信息学选修课,硕博连读期间就读于上海生科院计算生物所的生物信息学专业,并发布了多篇专业学术文章。

  2019年7月,姚佳英博士毕业,经过各种了解和比对后,看准了北京经开区强大生物医药产业背景的她,离开上海,将毕业后的首站选在了基因测序技术实力雄厚的安诺优达,入站后,负责安诺优达转录调控方向的大项目分析。

  2020年春节,是姚佳英博士毕业后的第一个春节,她开心地回到湖北黄冈老家,准备和家人分享自己参加工作后的喜悦和成长,但是,突如其来的疫情却将她原本的计划打乱,作为经开区一家专注于新一代基因组学技术产业化应用研究的国家高新技术企业,安诺优达响应疫情期间经开区对相关企业的号召,成立了新冠专家防疫小组,针对疫情开始相关科研攻关,作为小组成员的姚佳英,身在湖北,深切体会到了病原微生物对人体的危害性,为了对未知病原样本进行测序,鉴别病毒、分类、变异监控、预测病毒毒力,帮助治疗和预后,安诺优达结合近年来正在进行的病原微生物研究,基于二代和三代高通量测序技术,启动了全病原微生物检测与监控系统的研发,姚佳英及其科服生物信息中心团队开始负责整个项目的指导和系统搭建工作,主要研究如何针对新冠病毒等未知病原开发有效的技术手段,从而进行精准的测序,并结合公共数据库,开发一套较为完整的针对未知病原从高通量测序、数据分析、病原检测、进化监控的安诺云平台系统。

  该项研究利用三代测序平台的优势对未知病原体进行组装,不仅可以采取有效的技术手段对未知病原进行精准的测序,判断与其最接近的病原类型,对病毒变异和适应性进化进行追踪和解析,对新型病毒的毒力做出快速有效的判断,还可以利用其大数据分析优势,辅助改进检测试剂盒,降低其假阴性概率。此外该平台还提供多种分析方法及小工具,帮助没有数据分析能力的机构及企业进行数据分析,助力科研人员开展病原微生物研究,推进行业研究进展。

  项目启动后,被困湖北老家的姚佳英开始和电脑为伴,日夜研究、分析、处理相关数据。

  科研是一项无限重复试错的过程,2月至今,姚佳英不是在电脑跟前更新系统脚本、改bug、改参数、获取病毒样本数据、研究数据,就是在实验室查看实验进度,和实验团队召开会议,制定、修改实验方案,目前,“病原微生物检测与监控系统”已经完成七成左右,预计3个月后搭建完成。

  “平台完成后,不仅现在的新冠病毒,对以后的疫情都可起到预警作用,提前判断病毒种类,及时作出反应。”姚佳英说,并非所有科研工作者都有条件或者有很深的生物信息分析背景,该系统搭建完成后,科研人员可以依据平台数据,快速简便地获取病原的种类和遗传信息,如果检测出是未知病原,同样可以拿到全基因组序列,为后续的研究提供分子基础。

  保持着对科学的热爱,姚佳英在经开区这片支持创新、鼓励创新的热土上,和企业强强结合,不断地在实验中重复试探,努力推动着科研成果在这里转化应用。

  “厂房可以请人造,设备可以从外面买,但是人才一定要自己培养。”安诺优达CEO李志民告诉记者,希望博士后青年科学家的加入,助力企业各大业务线产业升级及重大产业项目的研发,将科技成果转化应用到产业发展中,推动中国精准医学的进程。

  融媒体中心记者 刘娜

 
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