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博奥晶典单细胞测序开始对外“接活”
3上一篇 2019年01月18日 版面导航 放大 缩小 默认        

博奥晶典单细胞测序开始对外“接活”

 

  本报讯(融媒体中心记者 张佩雯)近日,记者从北京博奥晶典生物技术有限公司(以下简称“博奥晶典”)获悉,公司BD Rhapsody单细胞分析系统已经完成平台搭建,并顺利完成全部测试,细胞捕获效率高达79%。随着测试实验的顺利完成,目前单细胞ATAC-seq测序开始正式对外承接服务。

  据介绍,此次测试博奥晶典共选取了5例人外周血单核(PBMC)细胞样本,分别进行了单样本单细胞实验、混合多样本的单细胞实验及平行对照组实验,数据分析的结果显示,5组实验的细胞平均捕获效率高达79%,为目前市场上所有主流单细胞测序平台最高。

  BD Rhapsody由扫描仪和上样仪两部分组成,其中扫描仪提供自动化细胞计数和细胞活性测试,制备适用于卡式芯片最佳浓度的细胞悬液。扫描仪的配置改善了10X Genomics整个过程盲做的弊端,全程实时监测样品质量,实验结果有迹可循,在BD Rhapsody扫描仪中清晰成像,不满意随时终止实验。同时搭载轻巧便携的BD Rhapsody上样台,可在实验室内轻松移动。

  高通量群体单细胞测序往往非常昂贵,BD Rhapsody单细胞分析系统设计有多种功能,实现更有效地利用测序来降低实验成本。采用与10X相似的样品标签技术,捕获mRNA的poly A尾,BD的单细胞捕获系统反应孔数量达到了22万个,细胞悬液由电子移液器注入孔注,自然沉降到U形孔中。另外,该系统包容性更强,目前监测细胞通量在100-1万均可,整体环境温和,对于细胞活性要求低,仅需要达到50%即可轻松上样。细胞与Beads有效结合后,可当即开展后续实验,也可以在低温条件下保存cDNA长达16周,这就意味着研究者可根据实验设计按需定制方案,提高用户体验。

  博奥晶典作为国内第一批引进10X Genomics平台的公司,率先在国内开展上万级通量的单细胞转录组测序服务。目前已经完成了1000多个样品、50种不同样品类的服务,覆盖的物种和样品类型包括人和小鼠的肝脏、肺脏、皮肤等,可开展9种单细胞测序产品的服务。

 
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